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利用Videometer多光谱成像系统研究镰刀菌抗性
发表时间:2021-06-23 17:10:50点击:1163
科学家开发了一种多光谱成像算法来评估小麦对镰刀菌(F. graminearum and F. culmorum)的抗性。获取结果与VDA方法视觉疾病评估)和qPCR方法进行了比较。研究目标是选择新型、快速的表型方法来替换现有评价的VDA抗性评估方法。
1. 视觉疾病评估方法与Videometer在不同生理阶段对麦穗和群体的相关性((360 - 1050 nm)
比RGB成像区分效果要好
VideometerLab® 以及传送带
2056x2056 像素/波段
1000粒种子扫描仅需5-10 min
感染镰刀菌小麦粒 CDA图像
基于典型判别分析(CDA)分析感染麦粒(黄/红),未感染 (蓝色)
-分类像素的阈值化
-Excel 结果输出
实验设计:
- 喷洒接种:F.graminearum & F. culmorum
- 冬小麦: 5栽培种 (抗性控制)
- 25 麦穗(2个重复)(使用 VDA和 Videometer)
田间视觉评分:
360°C dpi : % 结痂小穗 ; % FDK
成熟 : % FDK
Videometer : % FDK
培养皿
-单穗:第1次重复25穗/cv
-散装:≈从第2个重复的25个穗中收集1000粒/cv
传送带
‒散装≈从第二次重复的25个穗中收集1000粒/cv
qPCR
-5个品种≈第二次复制的1000粒/cv
-研磨每个品种的所有果仁,并从50 mg面粉中提取DNA
-具有特定TaqMan的qPCR® F.graminearum的探针
结果
在不同生理期的不同个体麦穗和群体
相关性总结
% 结痂麦穗s & % FDK
单个麦穗 &群体
‒ Videometer: 培养皿 & 传送带
‒ 360°C dpi评分 & 成熟
VDA (360°C麦穗和麦粒成熟) 与Videometer在麦粒成熟度上有很强相关性,以下模块:
‒单独麦穗& 群体
‒ Videometer带培养皿和传送带
在其它试验中,用F. graminearum接种,观察到了Microdochium spp自然侵染的微弱相关性。
2.qPCR, VideometerLab® 和VDA的疾病评估相关性。
在qPCR 于带传送带的Videometer 评估群体采集麦粒之间有高度相关性(R=0.91),qPCR与 VDA 在 360°Cdpi也有高度相关性(R=0.95),验证了VideometerLab® 在成熟阶段麦粒精确评估、快速定量镰刀菌的能力,这与抗性分类相一致。
使用VideometerLab®集合开发算法,在评价感染镰刀菌(Fusarium graminearum)和culmorum 的抗性时取得了很好的结果。更多时间将在更多品系小麦以及谷物上进行。针对该应用还可开发更多的算法。