Plant Phenomics | 基于自制番茄叶片病害的图像分割方法研究

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Plant Phenomics | 基于自制番茄叶片病害的图像分割方法研究

发表时间:2023-07-26 09:42:00点击:555

来源:植物表型组学

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番茄现在已经在全世界各地被广泛种植,但在其生长过程中不可避免地会产生各种病虫害。除了番茄果实上的病害,番茄叶片上的病害对番茄而言同样也是一种威胁。若是防治不及时,将会导致减产甚至绝收。人们早先通过经验主观地判断番茄病害所属类型。但是这样的方法分辨能力有限,不能准确地识别且耗时耗力。图像处理技术经过长期发展,已经被广泛的应用在各个方面,并且农业领域也渐渐兴起。但是,随着农业现代化发展朝着智能化方向不断推进,传统的图像识别方法将无法应对复杂的现实情况。随着计算机硬件设备性能的提升,将深度学习应用到农业生产中是未来农业的发展趋势。深度学习通过引入卷积层、池化层、全连接层等操作,自动提取图像特征,使得植物叶片病害识别有了突破性进展。快速、准确地识别番茄叶片病害并采取相应的防治措施,对保障作物生产、提高农民收入具有重要意义。


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图番茄叶片病害特征展示(在图A中,由于光照,标记点边缘细节模糊;在图B中,标记部分的疾病较小)


2023年4月,Plant Phenomics在线发表了中南林业科技大学、国防科学技术大学、爱达荷州大学、湖南省植物保护研究所题为 An effective image-based tomato leaf disease segmentation method using MC-UNet的研究论文。

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图MC-UNet结构图(A表示MC-UNet整体结构,B表示多尺度卷积模块,C表示跨层注意力融合机制)

本研究基于UNet结构,提出一种采用MC-UNet的番茄叶片病害图像分割方法。针对叶片边缘模糊问题,设计了一种多尺度卷积结构。首先应用了多个卷积核来捕获番茄叶片不同尺度的空间信息,后续的SE Module结构加强了网络对病害部分的感知能力以及病害边缘的表达能力。针对叶片微小病害的问题,提出了一种跨层注意力融合机制。在网络的各层上引入门控结构,门控结构可以突出不同尺寸的病害区域。将门控结果融合输出,以此综合各层的病害特征信息。在自制的番茄叶片病害分割数据集上,我们将MC-UNet与现有的分割网络进行对比,模型在参数量为6.67M的情况下达到了91.32%的准确率。

该研究由中南林业科技大学、国防科学技术大学、爱达荷州大学、湖南省植物保护研究所完成。中南林业科技大学邓榆宝为该文第一作者,周国雄为该文通讯作者。相关工作得到长沙市自然科学基金、国家自然科学基金等资助。


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周国雄 教授

论文链接:

http://doi.org/10.34133/plantphenomics.0049

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About Plant Phenomics

《植物表型组学》(Plant Phenomics)是由南京农业大学和美国科学促进会(AAAS)合作创办的英文学术期刊,于2019年1月正式上线发行。采用开放获取形式,刊载植物表型组学交叉学科热点领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、数据集和观点。具体范围涵盖高通量表型分析的最新技术,基于图像分析和机器学习的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育种和农业实践中的表型组学新应用,与植物表型相结合的分子生物学、植物生理学、统计学、作物模型和其他组学研究,表型组学相关的植物生物学等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等数据库收录。科睿唯安JCR2022影响因子为6.5,位于农艺学、植物科学、遥感一区。中科院农艺学、植物科学一区,遥感二区,生物大类一区(TOP期刊)。2020年入选中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊项目。

说明:本文由《植物表型组学》编辑部负责组稿。

中文内容仅供参考,一切内容以英文原版为准。

特邀作者:周国雄

排版:张婕(南京农业大学)

审核:孔敏、王平

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