Plant Phenomics | 叶片病害压力在多大程度上影响遥感氮状况?以条锈病为例研究

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Plant Phenomics | 叶片病害压力在多大程度上影响遥感氮状况?以条锈病为例研究

发表时间:2023-09-14 15:34:59点击:530

来源:植物表型组学

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在田间生产中,作物同时会受到多种胁迫,包括生物胁迫和非生物胁迫,它们都会导致作物产量和品质的降低,因此了解作物如何应对多重胁迫对于提高作物产量是至关重要的。随着高通量表型系统的发展与利用,其为评估作物胁迫提供了新的方法,但是数据采集、管理和分析的多样性带来了新的挑战。在此背景下,对作物胁迫的研究是一个突出和持续的过程,一个特别关注的领域是氮缺乏的检测。目前对氮状况的检测研究都是基于单个胁迫下的研究,但很少研究有涉及到多重胁迫间的相互作用对其检测的影响,因此需要进一步的研究来应对这些影响。

2023年6月,Plant Phenomics 在线发表了比利时列日大学题为To what extent does yellow rust infestation affect remotely sensed nitrogen status? 的研究论文。

本研究以小麦条锈病为例探讨了该病对反射率的测量和氮状态评估的影响,首先在为期两年的施氮试验中,利用多传感器遥感平台采集了小麦的RGB和多光谱图像,使用的SegVeg方法可以对图像进行有效的分割。

研究结果表明,SegVeg模型结合了EfficientNetB2290和Xgboost模型,可以有效地分割了整个数据集,即使在强烈的直射阳光条件下,也能非常准确地分割土壤、绿色元素和受损区域(图1)。此外研究发现病害不仅通过叶片损伤来影响作物反射率(表1),同时通过破坏作物的氮状况来影响健康区域的反射率(图2),将作物健康区域的NDRE植被指数和损害比例纳入模型可以有效减轻病害对氮状况遥感监测的影响(图3)。

该研究以小麦条锈病为例,融合了多种图像分析方法,准确分割了数据集,同时定量分析了作物病害对遥感氮状况检测的影响。强调了进一步研究多重胁迫对作物表型观测影响的重要性,为其他作物胁迫研究对氮状况影响提供了新思路。

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图1基于SegVeg方法的分割示例

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表1图像与叶片的brf之间以及叶片与绿色元素之间的变化率(%)

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图2主要生长阶段处理的NDREgreen值

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图3不同生育期NDRE与氮素状况变量的相关矩阵

论文链接:

http://doi.org/10.34133/plantphenomics.0‍083

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About Plant Phenomics

《植物表型组学》(Plant Phenomics)是由南京农业大学和美国科学促进会(AAAS)合作创办的英文学术期刊,于2019年1月正式上线发行。采用开放获取形式,刊载植物表型组学交叉学科热点领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、数据集和观点。具体范围涵盖高通量表型分析的最新技术,基于图像分析和机器学习的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育种和农业实践中的表型组学新应用,与植物表型相结合的分子生物学、植物生理学、统计学、作物模型和其他组学研究,表型组学相关的植物生物学等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等数据库收录。科睿唯安JCR2022影响因子为6.5,位于农艺学、植物科学、遥感一区。中科院农艺学、植物科学一区,遥感二区,生物大类一区(TOP期刊)。2020年入选中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊项目。

说明:本文由《植物表型组学》编辑部负责组稿。

中文内容仅供参考,一切内容以英文原版为准。

撰稿:严鑫(南京农业大学)

排版:向雪薇(南京农业大学)

审核:孔敏、王平

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