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Plant Phenomics | 安徽大学联合北京市农林科学院信息技术研究中心提出了基于计算智能的玉米冠层三维建模方法
发表时间:2024-04-07 16:48:21点击:246
作物群体3D模型是基于3D可视化计算的作物功能-结构模型研究的重要基础,群体3D模型直接影响后续光能利用效率计算和生产力预测等。然而,作物群体形态结构复杂,群体内部交叉遮挡严重,已有研究多通过单株复制或统计分布的方法构建,难以反应作物群体因交叉遮挡和资源竞争形成的群体结构特征。
2024年3月,Plant Phenomics在线发表了安徽大学和北京市农林科学院信息技术研究中心合作完成的题为Three-dimensional modelling of maize canopies based on computational intelligence的研究论文。
该文以玉米群体为例,提出一种基于计算智能的玉米群体三维建模方法。核心思想是认为玉米群体内的3D节单位是智能体(agent),通过群体内3D节单位方位角变化的智能调节使得群体截获更多的光能,最终实现不同品种、密度和环境条件下的玉米群体3D模型构建。通过t分布方法构建能够反应品种株型特征的玉米群体3D模型作为初始群体,以直射叶面积比例指标最大化作为优化目标,通过对3D节单位方位角进行迭代计算,实现光资源截获最大化的玉米群体3D模型的构建,进一步引入反思机制从群体整体的宏状态角度优化,并采用网格变形方法实现群体内部叶片微状态的碰撞检测与响应。
图1 迭代过程示意图,红色为进行旋转的3D节单位
利用该方法对2个品种3个密度的6个小区进行3D建模,结果表明植株相邻叶片方位角之差与田间实测数据对比的平均R2为0.71,覆盖度误差范围为7%-17%。另构建了12个密度梯度的玉米群体3D模型可以反应叶片分布垂直于行向的特征,垂直于行向的叶片比例在9×104株/公顷后呈现稳定增加的趋势。
图2 利用该方法构建的不同品种和密度玉米群体3D模型侧视图和顶视图
虽然所构建玉米群体3D模型与田间群体仍有差异,无法实现1:1的3D重建,但是能在一定程度上反应群体特征,对于玉米群体3D模型构建和作物功能结构模型研究也是一种促进。方法可以认为是一种面向三维空间作物资源高效利用的群体智能算法,为作物群体资源高效利用研究提供新思路。
论文链接:
http://spj.science.org/doi/abs/10.34133/plantphenomics.0160
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About Plant Phenomics
《植物表型组学》(Plant Phenomics)是由南京农业大学和美国科学促进会(AAAS)合作创办的英文学术期刊,于2019年1月正式上线发行。采用开放获取形式,刊载植物表型组学交叉学科热点领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、数据集和观点。具体范围涵盖高通量表型分析的最新技术,基于图像分析和机器学习的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育种和农业实践中的表型组学新应用,与植物表型相结合的分子生物学、植物生理学、统计学、作物模型和其他组学研究,表型组学相关的植物生物学等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等数据库收录。科睿唯安JCR2021影响因子为6.5,位于农艺学、植物科学、遥感一区。2023年中科院期刊分区位于农林科学大类一区。2020年入选中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊项目。
说明:本文由《植物表型组学》编辑部负责组稿。
中文内容仅供参考,一切内容以英文原版为准。
特邀作者:温维亮
排版:许怡瑶(南京农业大学)
审核:孔敏、王平