基于数字化植物表型平台(D3P)的田间小麦冠层光截获算法开发


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    基于数字化植物表型平台(D3P)的田间小麦冠层光截获算法开发

    发表时间:2020-05-11 16:06:29点击:1220

    来源:智慧农业

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    刘守阳、金时较、郭庆华、朱艳、Fred Baret1

    来源:智慧农业

    摘要:冠层光截获能力是反映作物品种间差异的重要功能性状,高通量表型冠层光截获对提高作物改良效率具有重要意义。本研究以小麦为研究目标,利用数字化植物表型平台( D3P )模拟生成了100种冠层结构不同的小麦品种在5个生育期的三维冠层场景,记录了从原始冠层结构中提取的绿色叶面积指数(GAI )、平均倾角( AIA )和散射光截获率(FIPARdif)信息作为真实值,进一步利用上述三维小麦场景开展了虚拟的激光雷达( LiDAR )模拟实验,生成了对应的三维点云数据。基于模拟的点云数据提取了其高度分位数特征(H)和绿色分数特征(GF)。较后,利用人工神经网络(ANN)算法分别构建了从不同 LiDAR 点云特征(H、GF和 H+GF )输入到FIPARdif、 GAI和AIA的反演模型。结果表明,对于GAI、AIA和FIPAR dif,预测精度从高到低对应的点云特征输入为 GF+H > H > GF 。由此可见,H特征对提高目标表型特性的估算精度起到了重要作用。输入 GF + H 特征,在中等测量噪音(10% )情况下,FIPAR dif和 GAI的估算均获得了满意精度,R2分别为 0.95 和 0.98 ,而 AIA 的估算精度(R2=0.20 )还有待进一步提升。本研究基于 D3P 模拟数据开展,算法的实际表现还有待通过田间数据进一步验证。尽管如此,本研究验证 D3P协助表型算法开发的能力,展示了高通量 LiDAR 数据在估算田间冠层光截获和冠层结构方面的较高潜力。

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    图 1 基于 D3P 和 ANN 的高通量冠层结构和光截获反演算法流程图

    Fig. 1 Flow chart of the D3P and ANN based inversion algorithm for the high-throughput phenotyping of canopy structure and light interception

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    图 2 数字化植物表型平台,D3P(翻译和修改自文献[16)

    Fig. 2 Digital Plant Phenotyping Platform,D3P(Revised from reference[16])

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    图 3  D3P 模拟的 RGB 图像(a)和 LiDAR 三维点云(b)

    Fig. 3 RGB imagery(a)and 3D LiDAR point cloud(b)generated  byD3P 

    关键词:冠层光截获;高通量表型;LiDAR;数字化植物表型平台(D3P)小麦冠层


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